Xã Bản Sen nằm ở phía nam của huyện Mường Khương, cách trung tâm huyện lỵ 35 km.

• Phía đông giáp xã La Pan Tẩn, huyện Mường Khương.
• Phía nam giáp xã Bản Cầm, huyện Bảo Thắng.
• Phía tây giáp xã Bản Lầu, huyện Mường Khương.
• Phía bắc giáp xã Lùng Vai, huyện Mường Khương.

Đây là một trong những xã vùng thấp của huyện Mường Khương. Xã có các dân tộc: Nùng chiếm 43%, Giáy, Tu Dí, Pa Dí, H'Mông, Mường, Kinh.[1]